Un technicien de laboratoire Ă  l'hĂŽpital de chirurgie reconstructive MSF d’Amman ensemence des milieux de culture. A lab technician at MSF's reconstructive surgery hospital in Amman seeds culture media. © Soriya Thach
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Antibiogo : une application révolutionnaire pour la lutte contre la résistance aux antibiotiques

L’application Antibiogo qui a rĂ©cemment obtenu la certification de conformitĂ© europĂ©enne (CE) sera dĂ©ployĂ©e dĂšs cet Ă©tĂ© dans plusieurs laboratoires de MĂ©decins Sans FrontiĂšres (MSF). Cet outil de diagnostic innovant, dĂ©veloppĂ© et testĂ© par la Fondation MSF pour les besoins des pays Ă  ressources limitĂ©es, sera, Ă  terme, disponible sous la forme d’une application gratuite et tĂ©lĂ©chargeable. Elle reprĂ©sente un espoir de taille pour ralentir l’antibiorĂ©sistance, un dĂ©fi majeur en matiĂšre de santĂ© publique.

Antibiogo est un outil de diagnostic qui permet aux techniciens et aux techniciennes de laboratoires de mesurer et d’interprĂ©ter des antibiogrammes, le test qui dĂ©termine la sensibilitĂ© des bactĂ©ries aux diffĂ©rents antibiotiques. Ce test est indispensable pour aider les mĂ©decins Ă  prescrire les antibiotiques les plus efficaces. La rĂ©sistance aux antimicrobiens (RAM), reconnue par l’OMS comme une menace majeure pour la santĂ© publique, a causĂ© 1,27 million de dĂ©cĂšs en 2019. Si rien n’est fait, elle pourrait ĂȘtre la premiĂšre cause de mortalitĂ© avec dix millions de morts par an dans le monde Ă  partir de 2050.

 

Une technicienne de laboratoire de bactériologie au CSREF Koutiala, Mali, ensemence des cultures.Ismael Diallo

 

« GrĂące Ă  Antibiogo, les techniciens et techniciennes de laboratoire et les microbiologistes, partout dans le monde, vont pouvoir lire et interprĂ©ter, directement sur leur tĂ©lĂ©phone, un antibiogramme et savoir quel est le profil de rĂ©sistance des bactĂ©ries responsables de l’infection des patients et des patientes. Bien utilisĂ©, il s’agit d’un fantastique outil de diagnostic qui aidera Ă  assurer un plus large accĂšs Ă  des tests bactĂ©riologiques de qualitĂ©, mĂȘme en l’absence de microbiologistes Â», explique Nada Malou, responsable du programme Antibiogo.  

 

“Cela permettra non seulement de traiter les personnes avec les antibiotiques les plus adaptĂ©s, mais aussi de rĂ©duire la rĂ©sistance aux antibiotiques”

Dr Nada Malou | Responsable Du Programme antibiogo

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Par ailleurs, la grande majoritĂ© des tests diagnostiques sont dĂ©veloppĂ©s dans les pays Ă  revenus Ă©levĂ©s dans une logique de marchĂ©, puis une fois rentabilisĂ©s, mis Ă  disposition des pays Ă  ressources limitĂ©es sans prendre en compte la spĂ©cificitĂ© de leurs contextes. « Antibiogo a ceci d’innovant qu’elle est nĂ©e dans les pays Ă  ressources limitĂ©es, a Ă©tĂ© dĂ©veloppĂ©e avec les utilisateurs et les utilisatrices de ces pays, et a Ă©tĂ© testĂ©e dans les communautĂ©s qui vont en bĂ©nĂ©ficier. Le modĂšle de dĂ©veloppement de ce dispositif mĂ©dical est l’inverse de celui que l’on connaĂźt habituellement, et rĂ©pond Ă  de rĂ©els besoins observĂ©s dans les pays Ă  ressources limitĂ©es Â», poursuit Nada Malou.  

Dans les pays Ă  revenus Ă©levĂ©s, la prescription d’antibiotiques est facilitĂ©e par l’utilisation d’automates pour la lecture et l’interprĂ©tation des antibiogrammes, et par l’expertise des microbiologistes. Mais dans les pays Ă  ressources limitĂ©es, dĂ©pourvus de ces Ă©quipements onĂ©reux et de microbiologistes cliniques en nombre suffisant, l’identification de l’antibiorĂ©sistance est bien plus compliquĂ©e, voire souvent absente.

Antibiogo est ainsi basĂ© sur le traitement d’images, une technologie d’intelligence artificielle et un systĂšme expert existant. En pratique, l’application permet au personnel des laboratoires de mesurer les diamĂštres d’inhibition qu’on retrouve sur les antibiogrammes, puis d’en interprĂ©ter les rĂ©sultats, sans forcĂ©ment dĂ©tenir une expertise en microbiologie, pourtant nĂ©cessaire jusqu’alors.

En situation, les rĂ©sultats montrent un trĂšs haut niveau de concordance, allant de 90 Ă  98 % en fonction des bactĂ©ries, lorsqu’ils sont comparĂ©s avec l’interprĂ©tation faite par des microbiologistes qualifié·e·s.  

L’application mobile Antibiogo dĂ©veloppĂ©e par La Fondation MSF sera d’abord utilisĂ©e dans des laboratoires de MSF au Mali, en RĂ©publique centrafricaine, en Jordanie et au YĂ©men, et sera dĂ©ployĂ©e plus largement par la suite. À terme, cet outil est destinĂ© aux professionnel·le·s de la santĂ© dans l’ensemble des pays Ă  ressources limitĂ©es. AprĂšs l’obtention de la certification finale en 2023, l’application sera tĂ©lĂ©chargeable par tous les laboratoires de microbiologie.