Un technicien de laboratoire à l'hôpital de chirurgie reconstructive MSF d’Amman ensemence des milieux de culture. A lab technician at MSF's reconstructive surgery hospital in Amman seeds culture media. © Soriya Thach
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Antibiogo : une application révolutionnaire pour la lutte contre la résistance aux antibiotiques

L’application Antibiogo qui a récemment obtenu la certification de conformité européenne (CE) sera déployée dès cet été dans plusieurs laboratoires de Médecins Sans Frontières (MSF). Cet outil de diagnostic innovant, développé et testé par la Fondation MSF pour les besoins des pays à ressources limitées, sera, à terme, disponible sous la forme d’une application gratuite et téléchargeable. Elle représente un espoir de taille pour ralentir l’antibiorésistance, un défi majeur en matière de santé publique.

Antibiogo est un outil de diagnostic qui permet aux techniciens et aux techniciennes de laboratoires de mesurer et d’interpréter des antibiogrammes, le test qui détermine la sensibilité des bactéries aux différents antibiotiques. Ce test est indispensable pour aider les médecins à prescrire les antibiotiques les plus efficaces. La résistance aux antimicrobiens (RAM), reconnue par l’OMS comme une menace majeure pour la santé publique, a causé 1,27 million de décès en 2019. Si rien n’est fait, elle pourrait être la première cause de mortalité avec dix millions de morts par an dans le monde à partir de 2050.

 

Une technicienne de laboratoire de bactériologie au CSREF Koutiala, Mali, ensemence des cultures.Ismael Diallo

 

« Grâce à Antibiogo, les techniciens et techniciennes de laboratoire et les microbiologistes, partout dans le monde, vont pouvoir lire et interpréter, directement sur leur téléphone, un antibiogramme et savoir quel est le profil de résistance des bactéries responsables de l’infection des patients et des patientes. Bien utilisé, il s’agit d’un fantastique outil de diagnostic qui aidera à assurer un plus large accès à des tests bactériologiques de qualité, même en l’absence de microbiologistes », explique Nada Malou, responsable du programme Antibiogo.  

 

“Cela permettra non seulement de traiter les personnes avec les antibiotiques les plus adaptés, mais aussi de réduire la résistance aux antibiotiques”

Dr Nada Malou | Responsable Du Programme antibiogo

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Par ailleurs, la grande majorité des tests diagnostiques sont développés dans les pays à revenus élevés dans une logique de marché, puis une fois rentabilisés, mis à disposition des pays à ressources limitées sans prendre en compte la spécificité de leurs contextes. « Antibiogo a ceci d’innovant qu’elle est née dans les pays à ressources limitées, a été développée avec les utilisateurs et les utilisatrices de ces pays, et a été testée dans les communautés qui vont en bénéficier. Le modèle de développement de ce dispositif médical est l’inverse de celui que l’on connaît habituellement, et répond à de réels besoins observés dans les pays à ressources limitées », poursuit Nada Malou.  

Dans les pays à revenus élevés, la prescription d’antibiotiques est facilitée par l’utilisation d’automates pour la lecture et l’interprétation des antibiogrammes, et par l’expertise des microbiologistes. Mais dans les pays à ressources limitées, dépourvus de ces équipements onéreux et de microbiologistes cliniques en nombre suffisant, l’identification de l’antibiorésistance est bien plus compliquée, voire souvent absente.

Antibiogo est ainsi basé sur le traitement d’images, une technologie d’intelligence artificielle et un système expert existant. En pratique, l’application permet au personnel des laboratoires de mesurer les diamètres d’inhibition qu’on retrouve sur les antibiogrammes, puis d’en interpréter les résultats, sans forcément détenir une expertise en microbiologie, pourtant nécessaire jusqu’alors.

En situation, les résultats montrent un très haut niveau de concordance, allant de 90 à 98 % en fonction des bactéries, lorsqu’ils sont comparés avec l’interprétation faite par des microbiologistes qualifié·e·s.  

L’application mobile Antibiogo développée par La Fondation MSF sera d’abord utilisée dans des laboratoires de MSF au Mali, en République centrafricaine, en Jordanie et au Yémen, et sera déployée plus largement par la suite. À terme, cet outil est destiné aux professionnel·le·s de la santé dans l’ensemble des pays à ressources limitées. Après l’obtention de la certification finale en 2023, l’application sera téléchargeable par tous les laboratoires de microbiologie.